Fagpressenytt

Vi ønsker å stoppe betalaktamase enzymene ved å lage hemmere eller inhibitorer, men også karakterisere enzymene biokjemisk ved å bestemme den tre dimensjonale (3D) strukturen ved røntgen krystallografi. For å forenkle arbeidet med å lage bedre inhibitorer, løser vi strukturer med både enzym og inhibitor, for lettere å se hvilken retning man skal utvide inhibitoren og om det er aminosyrer med bestemte egenskaper inhibitoren kan binde til eller en lomme vi kan fylle for å få bedre binding.

Vi startet med både et fragment bibliotek og samtidig med å forbedre andre hemmere. Fragment biblioteket, gave farmakoforer til å bygge videre på, for et fragment er for lite som en effektiv hemmer. Våre hemmere skal virke mot enten serine-beta-laktamaser (SBL) f.eks. enzymet OXA-48 eller mot metallbeta-laktamaser (MBL) mot VIM-2 (Fig. 1) og NDM-1 som er våre tre enzym targets. Alle disse enzymene finnes i antibiotika resistente bakterier i hele verden, og enzymene bryter ned alle klasser penicillin lignede antibiotikum, både penicilliner, cefalosporiner og karbapenemer.
Resultater
Fra fragment biblioteket